迷宫都市勒温。这个小镇聚集了许多冒险者，那里有一个怪物出没的迷宫。失去生命又转世的主角在迷宫中醒来。怎么看都像只小猫啊！ ？然而它的真实身份却是灾难级S级怪物‘巨兽’的幼年形态！他遇见了初出茅庐的D级冒险者阿莉亚。阿丽亚误认为他是一只小猫，把他带回家，在那里他受了重伤，治疗了他，并把他当作宠物，给他起名叫“小玉”。小玉被他的善良所感动，发誓要成为一名骑士来保护阿莉亚。小玉利用她的 S 级力量与阿莉亚一起在迷宫中冒险。你作为骑士（宠物）的日子从你遇到独特的朋友并且有时被宠爱开始！
真新镇的少年年满10岁之后，就可以得到训练神奇宝贝的资格。10岁的少年小智（松本梨香 配音）以成为最厉害的神奇宝贝训练大师为目标，即将踏上了修行之旅。小智因为早上赖床迟到，险些失去挑选神奇宝贝的资格，无奈下他领走了一只被挑剩下的神奇宝贝——皮卡丘（大谷育江 配音）。皮卡丘又名电气鼠，虽然长相可爱，但性格含羞内向却又不亲近人类，稍有不满就乱放电电人，暴躁的脾气让小智吃尽了苦头。大木博士把神奇宝贝图和宝贝球作为践行礼物送给了小智。在小智和皮卡丘的前方，神奇宝贝的世界有许多谜题和探险在等着他们，迎接他们的到底是光明还是黑暗，小智能否如愿成为神奇宝贝大师呢？
